首先我们来回顾一下正常的扩增曲线
标准S型扩增曲线
1. 一般呈S型,标准的基线平直或略微下降,无明显的上扬趋势;
2. 曲线拐点清楚,特别是低浓度样本指数期明显,扩增曲线整体平行性好;
3. 曲线指数期斜率与扩增效率成正比,斜率越大扩增效率越高。
1.1阴性对照有扩增,末尾起跳
原因分析:
(1) 实验操作过程存在交叉污染;
(2) 实验室环境存在阳性DNA气溶胶污染。
解决方案:
(1) 清理工作台面后,复检,排除交叉污染的可能性。若复检阴性正常,则前次实验可能为交叉污染造成;若复检仍为阳性,则实验环境可能存有阳性DNA气溶胶污染;
(2) 实验室出现阳性DNA气溶胶污染的情况下,应及时做好以下几点工作:a)对实验室进行通风处理,通风时间需要一天以上,通风期间可开展后续其它清理工作;b)清洁仪器设备/工作台面和地面,仪器设备表面可用纯净水多次擦拭(注:不可用84水擦拭,防止腐蚀仪器),工作台面和地面可以用10倍稀释的84水擦拭,然后再用自来水擦拭,清除84残留;c)有条件的实验室可用DNA清除液处理DNA污染;d)上述工作完成以后,使用新的耗材开展实验;
(3) 实验操作过程中尽量小心,防止溶液溅出,实验操作结束后及时清理工作台面和实验废弃物,不打开反应完的PCR管,PCR反应结束后,用一次性塑料袋或一次性塑料手套包裹PCR管,与其它实验废弃物一起清理,不得做高温高压处理;
(4) 定期对工作台面和实验室进行消毒。
1.2阳性对照(或内标)没有扩增,或者CT值大于预期
原因分析:
(1) 操作或移液器原因,即未加/少加阳性对照(或者样品不含内标DNA成分);
(2) 仪器温控系统损坏;
(3) 程序设置错误,未设置信号采集;
(4) 试剂保存出现问题。
解决方案:
(1)阴性对照结果正常,待测样品检测阳性情况下,不影响结果判读,也可重新检测,上机前检查各孔位的液面高度是否一致;
(2) 定期检查确认移液器精准度;
(3) 确认仪器故障情况下,联系厂家检修仪器;
(4) 影响结果判读,需更换试剂重新检测。
2.1前端鼓包/前几个循环有波动
原因分析:
(1)试剂未充分混匀;
(2)样本中杂质过多。
解决方案:
(1)上机前充分混匀,然后离心去除管内气泡;
(2)将样本离心后取上清液进行提取或者将样本稀释10倍后重新检测,尽量避免使用杂质过多的样本。
2.2扩增曲线从基线期上飘
原因分析:
(1)仪器默认基线期范围较小,导致仪器默认从基线期就开始扩增;
(2)如果都是同一孔位出现问题,则需进行仪器检修。
解决方案:
(1)可手动将基线范围调大,扩增曲线即可恢复正常;
(2)联系仪器厂家进行仪器检修,也可用棉签蘸取75%酒精在相应孔位进行擦拭,待酒精挥发后再用棉签蘸取ddH2O擦拭。
3.1终点荧光较低,且CT值较小
原因分析:
A2样本存在扩增抑制。可能是样本本身存有(或因取样过多、纯化度不够,核酸残留)过多抑制物如结构蛋白、脂肪、多糖等。
解决方案:
将样本稀释10倍后重新检测(抑制物的影响可通过稀释样本消除)。
在出现异常曲线之后,需要按照“人为因素、仪器因素、样本因素、试剂因素、其他因素”的思路进行逐一排查,任何结果仔细排查后都可以找到其原因,所以理清思路、具体原因具体分析是解决异常曲线的关键。
文章参考来源:诺唯赞动保, 生物制品圈.
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